Designskjema og løsning av polypeptidpeptidkjede

I. Sammendrag
Peptider er spesielle makromolekyler slik at sekvensene deres er uvanlige i deres kjemiske og fysiske egenskaper.Noen peptider er vanskelige å syntetisere, mens andre er relativt enkle å syntetisere, men vanskelige å rense.Det praktiske problemet er at de fleste peptider er lett løselige i vandige løsninger, så i vår rensing må den tilsvarende delen av det hydrofobe peptidet oppløses i ikke-vandige løsningsmidler. Derfor er disse løsningsmidlene eller bufferne sannsynligvis sterkt inkonsistente med bruken av biologiske eksperimentelle prosedyrer, slik at teknikere er strengt forbudt å bruke peptidet til egne formål, slik at det følgende er flere aspekter ved utformingen av peptider for forskere.

Designskjema og løsning av polypeptidpeptidkjede
For det andre, det riktige valget av syntetiske vanskelige peptider
1. Total lengde på nedregulerte sekvenser
Peptider på mindre enn 15 rester er lettere å oppnå fordi størrelsen på peptidet øker og renheten til råproduktet reduseres.Ettersom den totale lengden av peptidkjeden øker utover 20 rester, er nøyaktig produktmengde et sentralt problem.I mange eksperimenter er det lett å få uventede effekter ved å senke resttallet under 20.
2. Reduser antall hydrofobe rester
Peptider med stor overvekt av hydrofobe rester, spesielt i området 7-12 rester fra C-terminalen, forårsaker vanligvis syntetiske vanskeligheter.Dette blir sett på som en utilstrekkelig kombinasjon nettopp fordi det oppnås et B-fold ark i syntesen."I slike tilfeller kan det være nyttig å konvertere mer enn to positive og negative rester, eller å sette Gly eller Pro inn i peptidet for å låse opp peptidsammensetningen."
3. Nedregulering av "vanskelige" rester
"Det er en rekke Cys-, Met-, Arg- og Try-rester som vanligvis ikke syntetiseres lett."Ser vil typisk bli brukt som et ikke-oksidativt alternativ til Cys.
Designskjema og løsning av polypeptidpeptidkjede

For det tredje, forbedre riktig valg av løselig i vann
1. Juster N- eller C-terminalen
I forhold til sure peptider (det vil si negativt ladet ved pH 7), er acetylering (N-terminus acetylering, C-terminus alltid opprettholder en fri karboksylgruppe) spesielt anbefalt for å øke den negative ladningen.Men for basiske peptider (det vil si positivt ladet ved pH 7), anbefales spesielt aminering (fri aminogruppe ved N-terminalen og aminering ved C-terminalen) for å øke den positive ladningen.

2. Forkort eller forleng sekvensen kraftig

Noen av sekvensene inneholder et stort antall hydrofobe aminosyrer, som Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr og Ala osv. Når disse hydrofobe restene overstiger 50 % er de vanligvis ikke lette å løse opp.Det kan være nyttig å forlenge sekvensen for ytterligere å øke de positive og negative polene til peptidet.Det andre alternativet er å nedregulere størrelsen på peptidkjeden for å øke de positive og negative polene ved å nedregulere de hydrofobe restene.Jo sterkere de positive og negative sidene av peptidkjeden er, jo mer sannsynlig er det å reagere med vann.
3. Ha i en vannløselig rest
For noen peptidkjeder kan kombinasjonen av noen positive og negative aminosyrer forbedre vannløseligheten.Vårt firma anbefaler at N-terminalen eller C-terminalen av sure peptider kombineres med Glu-Glu.N- eller C-terminalen til det grunnleggende peptidet ble gitt og deretter Lys-Lys.Hvis den ladede gruppen ikke kan plasseres, kan Ser-Gly-Ser også plasseres i N- eller C-terminalen.Denne tilnærmingen fungerer imidlertid ikke når sidene av peptidkjeden ikke kan endres.